My primary research program is built on applying genomic and physiological methods to understand immune response in populations worldwide. I utilize an evolutionary medicine approach to understand how society shapes population history. My research agenda combines cutting edge methodology with the theoretical tenets of Evolutionary Biology, Immunity, and Methods Development for Precision Medicine to understand how evolutionary processes shape modern health disparities. Below are a few of my current projects:
Mi programa de investigación principal se basa en la aplicación de métodos genómicos y fisiológicos para comprender la respuesta inmune en poblaciones de todo el mundo. Utilizo un enfoque de medicina evolutiva para comprender cómo la sociedad da forma a la historia de la población. Mi agenda de investigación combina una metodología de vanguardia con los principios teóricos de la biología evolutiva, la inmunidad y el desarrollo de métodos para la medicina de precisión para comprender cómo los procesos evolutivos da forma a las disparidades de salud modernas. A continuación se muestran algunos de mis proyectos actuales:
Dengue Infection
Over the past few years, I have established on-going research collaborations with Leticia del Carmen Castillo Signor, MA at the Ministry of Public Health and Social Assistance in Guatemala (MSPAS). With MSPAS’s assistance, I collected epidemiological surveys, serum, and whole blood samples for DNA from 2018 to 2019 from case and control participants to study Dengue infection. In 2021, I evaluated 5 pro inflammatory cytokines in the collected cohort at Dr. Rafael Fernandez Botran’s laboratory at the University of Louisville. These data will be used to evaluate genetic susceptibility and resistance to infection, alongside various biological markers. We hope to expand on these analyses in the upcoming years to create cost effective strategies for treating patients using targeted cytokine pathways.
HLA and Diversity
I am working with Dr. Omar Cornejo at the University of California, Santa Cruz to evaluate the genetic diversity and the effects of local ancestry of worldwide populations in the entire MHC/HLA region. Given the complexity of the region, we are investigating how the mapping reference (hg38, chm13, pangenome) affects the diversity we see present. Understanding the diversity present will be key to developing better targeted sequencing for the entire MHC complex.
HIV and other autoimmune disorders
I am collaborating with Dr. Jairam Lingappa at the University of Washington to examine rare genetic variation in HIV and other autoimmune disorders such as Type I diabetes. We aim to quantify the risk in the mucosal inflammatory pathway and gain a more in depth understanding of the epidemiological risk and social factors affecting HIV infection.
Polynesian Population History
I am collaborating with Dr. Alexander Ioannidis at the University of California Santa Cruz to examine migration and natural selection in the Polynesian Islands. We aim to understand how the past history affects modern health outcomes.
Natural Selection to Malaria in Nepal
I am collaborating with Dr. Aashish Jha at New York University Abu Dhabi to examine natural selection to malaria in lowland Nepalese populations. We are interesting in pinpointing population-specific signatures of selection to conduct further analyses about the function of those regions.
infección por el dengue
En los últimos años, he establecido colaboraciones de investigación continua con Leticia del Carmen Castillo Signor, MA en el Ministerio de Salud Pública y Asistencia Social de Guatemala (MSPAS). Con la ayuda del MSPAS, recopilé encuestas epidemiológicas, muestras de suero y sangre para ADN de 2018 a 2019 de participantes de casos y controles para estudiar la infección por dengue. En 2021, evalué 5 citoquinas proinflamatorias en la cohorte recolectada en el laboratorio del Dr. Rafael Fernández Botran en la Universidad de Louisville. Estos datos se utilizarán para evaluar la susceptibilidad genética y la resistencia a la infección, junto con varios marcadores biológicos. Esperamos ampliar estos análisis en los próximos años para crear estrategias rentables para el tratamiento de pacientes que utilizan vías de citoquiinas específicas.
HLA y Diversidad
Estoy trabajando con el Dr. Omar Cornejo en la Universidad de California, Santa Cruz para evaluar la diversidad genética y los efectos de la ascendencia local de poblaciones mundiales en toda la región MHC/HLA. Dada la complejidad de la región, estamos investigando cómo la referencia genética (hg38, chm13, pangenoma) afecta la diversidad que vemos presente. Comprender la diversidad presente será clave para desarrollar una secuenciación mejor dirigida para todo el complejo MHC.
VIH y otras enfermedades autoinmunes
Estoy colaborando con el Dr. Jairam Lingappa de la Universidad de Washington para examinar variaciones genéticas raras en el VIH y otros trastornos autoinmunes como la diabetes tipo I. Nuestro objetivo es cuantificar el riesgo en la vía inflamatoria de las mucosas y obtener una comprensión más profunda del riesgo epidemiológico y los factores sociales que afectan la infección por VIH.
Historia de la población polinesia
Estoy colaborando con el Dr. Alexander Ioannidis de la Universidad de California en Santa Cruz para examinar la migración y la selección natural en las islas de la Polinesia. Nuestro objetivo es comprender cómo la historia pasada afecta los resultados de salud modernos.
Selección natural contra la malaria en Nepal
Estoy colaborando con el Dr. Aashish Jha de la Universidad de Nueva York en Abu Dhabi para examinar la selección natural de la malaria en las poblaciones de las tierras bajas de Nepal. Nos interesa identificar firmas de selección específicas de la población para realizar análisis adicionales sobre la función de esas regiones.